MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7107 chromosome

Total Repeats: 24967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019676	AGC	2	6	14	19	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019676	ACT	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019676	TTAAG	2	10	1489	1498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019676	A	6	6	1502	1507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019676	ATTAAA	2	12	1510	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019676	A	7	7	1533	1539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019676	TCA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019676	CAT	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019676	ATT	2	6	1683	1688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019676	A	6	6	1734	1739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019676	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019676	A	6	6	3003	3008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019676	T	6	6	5989	5994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019676	GA	4	8	6970	6977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019676	A	6	6	8119	8124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019676	AGT	2	6	8201	8206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019676	AATTT	2	10	8208	8217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019676	TAA	2	6	8223	8228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019676	A	6	6	8246	8251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019676	TAT	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019676	CAA	2	6	8398	8403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019676	CCA	2	6	8472	8477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019676	CAC	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019676	TA	3	6	9099	9104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019676	TGGG	2	8	9791	9798	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019676	CCCA	2	8	9804	9811	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_019676	T	6	6	11336	11341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019676	AAAG	2	8	11362	11369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019676	TCA	2	6	11442	11447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019676	T	6	6	12302	12307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019676	TAA	2	6	12364	12369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019676	TTAA	2	8	12402	12409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019676	A	6	6	13499	13504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019676	AAT	2	6	13523	13528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019676	T	8	8	13528	13535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019676	TAA	2	6	13556	13561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019676	GTA	2	6	14565	14570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019676	CAA	2	6	14583	14588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019676	AT	3	6	14589	14594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019676	TAA	2	6	15031	15036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019676	AAG	2	6	15079	15084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019676	T	6	6	15094	15099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019676	AAAT	2	8	15106	15113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019676	AT	4	8	17658	17665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019676	TAA	2	6	17666	17671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019676	AAG	2	6	17746	17751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019676	TAA	2	6	17789	17794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019676	T	7	7	17802	17808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019676	T	6	6	17866	17871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019676	TAA	2	6	17889	17894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019676	CTAG	2	8	17898	17905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019676	AG	3	6	17904	17909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019676	CA	3	6	18004	18009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019676	A	6	6	18020	18025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019676	ATGA	2	8	18061	18068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019676	TTACT	2	10	18112	18121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019676	GGA	2	6	18243	18248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019676	AAG	2	6	18283	18288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019676	ATCA	2	8	18346	18353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019676	GGT	2	6	18370	18375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019676	AAT	2	6	18462	18467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019676	GAG	2	6	18539	18544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019676	ACA	2	6	19349	19354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019676	AGG	2	6	21216	21221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019676	AGG	2	6	21223	21228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019676	AGG	2	6	21230	21235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019676	TTAC	2	8	21248	21255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019676	CCAG	2	8	22257	22264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019676	ATTA	2	8	22297	22304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019676	TA	3	6	22309	22314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019676	AAT	2	6	22379	22384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019676	A	7	7	22406	22412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019676	CTT	2	6	22439	22444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019676	TGC	2	6	22486	22491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019676	CTA	2	6	22530	22535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019676	CAA	2	6	22557	22562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019676	T	6	6	22595	22600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019676	AAG	2	6	23210	23215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019676	TTG	2	6	23220	23225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019676	CAG	2	6	23288	23293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019676	TTA	2	6	23330	23335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019676	AAGT	2	8	23342	23349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019676	TGG	2	6	23350	23355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019676	TGT	2	6	23381	23386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019676	CTG	2	6	23400	23405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019676	CAA	2	6	23442	23447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019676	ACC	2	6	23465	23470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019676	TA	3	6	23475	23480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019676	CAA	2	6	23586	23591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019676	TG	3	6	25640	25645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019676	T	7	7	25690	25696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019676	CAG	2	6	26593	26598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019676	ATA	2	6	26773	26778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019676	GATA	2	8	26798	26805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019676	TTC	2	6	26831	26836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019676	ACTA	2	8	27072	27079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019676	TATTTA	2	12	27140	27151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019676	TAT	2	6	27545	27550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019676	A	6	6	27554	27559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019676	GTC	2	6	28198	28203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019676	ATT	2	6	28231	28236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019676	TC	3	6	28303	28308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019676	A	6	6	29008	29013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019676	ATC	2	6	29030	29035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019676	TGA	2	6	29039	29044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019676	A	6	6	29065	29070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019676	TGA	2	6	29072	29077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019676	A	6	6	29101	29106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019676	GCT	2	6	29112	29117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019676	ATC	2	6	29136	29141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019676	GATAT	2	10	29154	29163	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019676	GTT	2	6	32364	32369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019676	TTC	2	6	32384	32389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019676	AT	3	6	32406	32411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019676	GTT	2	6	32415	32420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019676	TCA	2	6	32443	32448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019676	A	8	8	32448	32455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019676	TGA	2	6	32548	32553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019676	A	6	6	32611	32616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019676	TAA	2	6	33176	33181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019676	TTTAG	2	10	33563	33572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019676	AGC	2	6	33619	33624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019676	TAG	2	6	34103	34108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019676	TCA	2	6	34802	34807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019676	AC	3	6	34843	34848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019676	ATT	2	6	34854	34859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019676	TCAA	2	8	34894	34901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019676	TAT	2	6	34907	34912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019676	CT	3	6	34927	34932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019676	CAG	2	6	34958	34963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019676	T	7	7	34981	34987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019676	ATAA	2	8	35042	35049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019676	TAA	2	6	35101	35106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019676	AATC	2	8	36677	36684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019676	A	6	6	36686	36691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019676	ATC	3	9	37937	37945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019676	T	6	6	37952	37957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019676	TTA	2	6	37963	37968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019676	GAT	2	6	38477	38482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019676	AAT	2	6	39793	39798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019676	AGA	2	6	39814	39819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019676	AAAT	2	8	39853	39860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019676	GTAA	2	8	39876	39883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019676	CAA	2	6	39981	39986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019676	ATTA	2	8	41933	41940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019676	TCTTA	2	10	41976	41985	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019676	T	6	6	42433	42438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019676	TG	4	8	42452	42459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_019676	AAG	2	6	42515	42520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_019676	TAT	2	6	43500	43505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_019676	ATT	2	6	43631	43636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_019676	T	6	6	84960	84965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_019676	A	6	6	86152	86157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_019676	ACC	2	6	86191	86196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
296	NC_019676	TAT	2	6	86201	86206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_019676	TTC	2	6	88705	88710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_019676	T	6	6	88713	88718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_019676	CAA	2	6	88772	88777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NC_019676	ATAA	2	8	88980	88987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_019676	T	6	6	89030	89035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_019676	ACAA	2	8	89104	89111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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306	NC_019676	AATC	2	8	89263	89270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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312	NC_019676	AAG	2	6	90769	90774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
313	NC_019676	T	7	7	90794	90800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_019676	CTG	2	6	90839	90844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
315	NC_019676	CAA	2	6	90993	90998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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320	NC_019676	TTA	2	6	93674	93679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_019676	GAATT	2	10	97600	97609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
323	NC_019676	T	6	6	97618	97623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_019676	T	6	6	97655	97660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_019676	AT	3	6	97668	97673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_019676	TA	3	6	100786	100791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_019676	TTTA	2	8	100833	100840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_019676	AGTTA	2	10	101130	101139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
331	NC_019676	TCT	2	6	101175	101180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
332	NC_019676	ACTT	2	8	101211	101218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
333	NC_019676	AAC	2	6	101233	101238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
334	NC_019676	AGG	2	6	102352	102357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_019676	CTT	2	6	103708	103713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
338	NC_019676	CTT	2	6	103719	103724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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344	NC_019676	AT	3	6	103984	103989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
345	NC_019676	AC	3	6	104012	104017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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374	NC_019676	T	6	6	112415	112420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_019676	GTCT	2	8	119535	119542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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420	NC_019676	GAC	2	6	127044	127049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_019676	TC	3	6	127496	127501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
422	NC_019676	AGG	2	6	127569	127574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
423	NC_019676	TAAC	2	8	129762	129769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
424	NC_019676	TTA	2	6	133070	133075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_019676	ACT	2	6	133108	133113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_019676	AAAATT	2	12	133284	133295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_019676	CAA	2	6	138559	138564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_019676	ATG	3	9	138599	138607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_019676	TTTA	2	8	138608	138615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_019676	CAA	2	6	141804	141809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_019676	TTGAA	2	10	141814	141823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
434	NC_019676	AATTC	2	10	141825	141834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_019676	T	7	7	142138	142144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_019676	A	6	6	142161	142166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_019676	AGA	2	6	144504	144509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_019676	ATT	2	6	145662	145667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_019676	AAT	2	6	145812	145817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_019676	ATT	2	6	150734	150739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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